马波沙星抗菌谱广，抗菌活性强，对多数肠杆菌、多杀性巴斯德氏菌、绿脓杆菌、金黄葡萄球菌、中间葡萄球菌的MIC90分别为0.08～0.28、0.04、0.94、0.2和0.23μg/mL，与恩诺沙星和环丙沙星相当。对牛呼吸道病原菌如多杀性巴斯德氏菌、溶血性巴斯德氏菌、昏睡嗜血杆菌及支原体的MIC90分别为0.02、0.17、0.03和0.48μg/mL。。

马波沙星内服与注射后吸收迅速而完全，血浆蛋白结合率低，组织分布广，在肾、肝、肺及皮肤中分布良好，其血浆中和组织中浓度高于对多数病原菌的MIC，怀孕母猪和猫的口服生物利用度约80%，犊牛则达100%以上。

本品有较大的分布容积，除中枢神经外，所有被检测的组织浓度均高于血浆中药物浓度，部分在肝中被代谢转化为无活性的代谢物(N-脱甲基MBF和N-氧MBF)，主要排泄途径为肾脏，犬在尿中排出占30%～45%的原型药。半衰期较长，从而使给药后的有效血药浓度维持时间较长。